Historia
La historia narra que hace mucho tiempo, una diosa con el poder de su lira salvó a la humanidad, y creó la tierra flotante Altárea/Neburia, lugar donde unos pocos seres humanos fueron para ser salvados; a todos los humanos se les entregó un ave de gran magnitud llamado Pelicaro/Neburi para evitar que cayeran a las tierras inferiores. La historia empieza como ya es costumbre con Link, durmiendo y esta vez va a ser despertado por el Pelicaro/Neburi de Zelda, el cual lleva una carta de esta, en la que pedía que se vieran juntos. Link, va a la efigie de la diosa para hablar con Zelda y al terminar, Link busca a su Pelicaro/Neburi. Después de encontrarlo, comienza el Torneo Celeste, al final, Link gana, y él y Zelda van a la efigie de la diosa. Después Zelda le entrega el paracaidas. Finalmente, Zelda, le propone una "cita" a Link(le propone dar un paseo por Altárea/Neburia). Pero entonces aparece un torbellino y se traga a Zelda, aunque Link consigue salvarse. Después de un rato, Link conoce a Fay, que fue creada por la Diosa para servir a Link, el elegido, a quién guiará y aconsejará siempre que lo necesite. Ella le dice que hay que ir a las tierras inferiores. Ahí comienza nuestra aventura. La aventura se desarrollara en tres mundos: Bosque de Farone, Volcán de Eldin y Desierto de Lanayru. El juego esta dividido en tres fases:
Búsqueda de Zelda: Link recorrerá las tres regiones del mundo inferior para encontrar a Zelda. Aquí obtendremos la lira de la diosa.
Creación de la Espada Maestra: Link deberá fortalecer la espada divina con las tres llamas sagradas, una en cada región, una vez acabado, obtendremos la Espada Maestra, pero eso si, no será fácil, deberemos superar tres juicios del espíritu para fortalecerlo.
Conseguir el cantar del Héroe: Link, para encontrar la Trifuerza, necesitará esta canción para hacer el juicio del espíritu en Altárea/Neburia y obtener una gema, que deberá ser colocada en una estatua que hay en Altárea/Neburia. Entonces la isla de la diosa, situada en Altárea/Neburia, volvera a las tierras inferiores, en la tierra del presidio, eliminando completamente al Heraldo de la muerte, pero Grahimsecuestrará a Zelda y resucitará al Heraldo de la muerte.
Al final, deberemos derrotarlo, así, el juego habrá acabado. Después el juego te dirá si quieres comenzar el modo héroe(es más difícil, no habran corazones ni flores de corazón, deberas tener un uso intensivo de pociones y/o hadas, a menos que tengas un medallón de corazón), pero eso si, lo hará en el fichero en el que estas jugando, así que si lo quieres conservar, copialo en otro fichero.
El juego se sitúa cronológicamente antes de los acontecimientos sucedidos en Ocarina of Time. Esta vez no aparecerá Epona, sino que el transporte de Link será un pelícaro/neburi, el ave que se mostró en el E3 2011. Link usará un instrumento tal y cómo lo hizo en Ocarina of Time y Majora's Mask con laOcarina del Tiempo y en The Wind Waker con la Batuta de los vientos, esta vez Link usará una lira (arpa) al igual que Sheik lo hacía en Ocarina of Time.
Este juego tiene lugar en dos tierras, las cuales son Altarea/Neburia y las tierras inferiores.
